交通部14日宣布，自3月31日起向每位轉機過境旅客收取「轉機過境設施使用費」新台幣500元，這也是桃機開航44年來首度收取轉機設施使用費，由於99%旅客都是在桃園機場轉機，估計桃機一年將可增加新台幣15億元收入，但目前運量尚未完全恢復，推估今年約可收到5.5億元。

考量近年受疫情影響，機場配合執行防疫措施，強化各項軟硬體設施，導致增加成本，並參考鄰近國家標竿機場的做法，交通部14日宣布自3月31日起向每位轉機過境旅客收取「轉機過境設施使用費」新台幣500元，相關費用將挹注桃園機場營業基金，做為建設支出及維護營運成本。

交通部航政司副司長韓振華說，來台轉機旅客平均停留時間為5小時，由於轉機過境旅客以外國人士為主，收取本費用不致對國人產生影響。他說：『(原音)轉機過境設施使用費500元，將由航空公司隨票來徵收，他收取的時間是以旅客開票日為準。如果轉機旅客沒有持有轉機設施使用費的機票的話，那就必須要在轉機櫃檯補繳相關的費用；如果他已繳納相關費用，但是實際上沒有轉機的話，他也是可以申請全額退費。』

韓振華指出，日本成田機場向轉機過境旅客收取的使用費約新台幣360元，韓國仁川機場約新台幣250元，新加坡樟宜機場約新台幣200元，香港機場則較高、近新台幣925元。

韓振華表示，在疫情前，2019年桃園機場轉機出境旅客約296萬人次，其中約有8成來自東南亞往返美加地區，若以該年轉機出境旅客量估算，一年約可收取15億元轉機過境使用費。不過，由於目前航點、運量尚未完全恢復，今年1至2月僅有20萬人轉機出境，推估全年約120萬人次，達2019年的4成左右，其中桃機佔比99%，僅有1%、約1萬人是在高雄小港機場轉機，預計桃機今年將可收取5.5億轉機過境使用費。

除了新增的轉機過境設施使用費，我國自1969年起便向每位出境旅客收取機場服務費，韓振華指出，2019年桃機旅客量約4,868萬人次，出境旅客約2,418萬人次，機場服務費年收入約106億元，由桃機公司與觀光局收取各半；隨著邊境開放，目前桃機運量已明顯復甦，1、2月入出境旅客共409萬人次，已達疫情前2019年的52%，預估今年旅客量可超過2千萬人次以上，距離原先水準一年4,800多萬人次，將近一半左右。